Von Rafina aus fahren das ganze Jahr über Fähren zu den Inseln, in der Hochsaison sind die Verbindungen jedoch häufiger.
• Santorin: Dies ist eine der beliebtesten Routen in diesem Hafen. Beachten Sie jedoch, dass die Fähren, die diese Strecke bedienen, von Mai bis Oktober saisonal verkehren. Während dieser Zeit verkehrt in der Regel täglich eine Hochgeschwindigkeitsfähre nach Santorin. Die Fahrt von Rafina nach Santorin dauert etwa 6 Stunden. Die Fährgesellschaft, die diese Verbindung anbietet, ist Golden Star Ferries.
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• Mykonos: Den ganzen Sommer über verkehren täglich zahlreiche Fähren von Rafina nach Mykonos. Jeden Tag verkehren mindestens 6 Fähren zwischen den beiden Orten. Die Strecke wird sowohl von Hochgeschwindigkeitsfähren als auch von herkömmlichen Fähren befahren. Die Überfahrt dauert 2 bis 3 Stunden mit einer Hochgeschwindigkeitsfähre und etwa 4 Stunden mit einer herkömmlichen Fähre. Die Fährgesellschaften, die diese Strecke bedienen, sind Fast Ferries, Seajets und Golden Star Ferries.
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• Andros: Rafina ist die einzige Überfahrt von Athen nach Andros; aus diesem Grund gibt es viele Fährrouten nach Andros. Vor allem im Sommer werden täglich mindestens 5 Überfahrten angeboten. Die Überfahrt mit den konventionellen Fähren dauert etwa 2 Stunden, während das Hochgeschwindigkeitsschiff etwa eine Stunde braucht, um die Insel zu erreichen. Fast Ferries und Golden Star Ferries sind die Reedereien, die die konventionellen Fähren besitzen. Die Hochgeschwindigkeitsfähre hingegen gehört zur Flotte von Seajets.
• Tinos: Die Anreise nach Tinos von Rafina aus ist einfach und schnell. Fähren nach Tinos gibt es das ganze Jahr über, wobei die Häufigkeit der Fahrten im Sommer zunimmt. Insbesondere fahren mindestens 8 Fähren (konventionelle und Hochgeschwindigkeits-/Katamaranfähren) von Rafina nach Tinos. Fast Ferries, Golden Star Ferries, Seajets und Blue Star/Hellenic Seaways sind die Eigentümer der Schiffe, die nach Tinos fahren. Die Dauer der Überfahrt liegt zwischen 2 und 4 Stunden (ungefähr).
• Paros: In der Hochsaison gibt es täglich mindestens 2 Überfahrten von Rafina nach Paros. Eine konventionelle Fähre und zwei Hochgeschwindigkeitsfähren bedienen die Strecke, wobei die Dauer der Überfahrt etwa 4 Stunden für die Hochgeschwindigkeitsfähren und 6,5 Stunden für die konventionellen Fähren beträgt. Die Schiffe, die Paros erreichen, gehören zu Seajets, Fast Ferries und Golden Star Ferries.
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• Naxos: Die Fähren von Rafina nach Naxos verkehren saisonal. Eine konventionelle Fähre und eine Hochgeschwindigkeitsfähre verbinden die Insel einmal täglich, und die Fahrt dauert etwa 5,5 Stunden bzw. 3 Stunden. Fast Ferries ist Eigentümer der konventionellen Fähre, die diese Strecke bedient, während Seajets Eigentümer der Hochgeschwindigkeitsfähre ist.
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